Indel (insertion/deletion)
Indel är ett samlingsbegrepp för genetiska varianter där en eller flera DNA-baser har lagts till (insertion) eller tagits bort (deletion) i arvsmassan. Termen är en sammandragning av de engelska orden insertion och deletion.
En indel uppstår när antalet byggstenar i en DNA-sträng förändras jämfört med en referenssekvens. Till skillnad från en punktmutation, där en enda bas byts ut mot en annan, innebär en indel att DNA-strängen blir antingen längre eller kortare. Förändringen kan omfatta allt från en enda bas till hundratals baser i rad.
För att förstå skillnaden kan man jämföra med en mening. En punktmutation byter ut en bokstav, till exempel från KATT till KOTT. En insertion lägger till bokstäver, så att KATT blir KARTT, medan en deletion tar bort bokstäver, så att KATT blir KAT. I cellen handlar det inte om bokstäver utan om baserna A, T, C och G, men principen är densamma.
Indels kan ha mycket olika betydelse beroende på var de inträffar. Sker en indel mitt i en gen kan den orsaka en så kallad läsramsförskjutning, där hela den genetiska koden efter förändringen läses fel. Det kan leda till ett icke fungerande protein och i vissa fall sjukdom. En känd ärftlig sjukdom som ofta orsakas av en deletion är cystisk fibros. Andra indels ligger i delar av arvsmassan som inte kodar för proteiner och saknar då ofta märkbar effekt.
Inom DNA-tester och släktforskning är indels en av flera typer av genetiska markörer som forskare och laboratorier analyserar. De är mindre vanliga än SNP:ar (enbaspolymorfismer), som är de markörer som dominerar i autosomala släktforskningstester. Indels förekommer dock även i Y-DNA-analyser, där vissa längre insertions- och deletionshändelser kan användas för att dela in haplogrupper och spåra djupare släktskap på den manliga linjen.
För den som tolkar resultat från ett DNA-test är det sällan nödvändigt att känna till varje enskild indel. Men begreppet dyker ofta upp i rapporter, vetenskapliga sammanhang och hälsorelaterade analyser. Att förstå att en indel helt enkelt betyder att DNA har blivit längre eller kortare gör det lättare att förstå hur variation i arvsmassan uppstår och hur den kan påverka allt från utseende till sjukdomsrisk.
